随着人们对有机锡化合物性质的逐步认识，有机锡的产品和消耗迅速增长。目前有机锡主要应用于三大领域聚氯乙烯的稳定剂、工业催化剂、工农业防腐剂和杀虫剂。在我国，有机锡广泛地被应用于工农业杀虫剂、除草剂、纺织品防霉剂和船舶防污涂料中。
然而，有机锡对环境的污染是非常大的。有机锡污染主要针对海洋环境，它主要通过PVC、防污涂料、杀生剂对海洋进行污染。有机锡化合物在PVC的制造过程中产生，从PVC产品上或处理过程中浸出，进入城市和工业废水，最终进入海洋。防污涂料主要附着在船舶周围，其作用是释放有毒的有机锡，阻止水生生物在船体上附着。但是大量的有机锡化合物进入海洋中，也会影响到许多非目标生物。杀生剂主要用来控制农作物的细菌病和真菌病，大多采用喷洒法施药，对土壤、大气、水域产生直接污染，在通过地表、地下水进入海洋。
有机锡进入海洋后能够导致海洋浮游植物的光合能力的削弱，而浮游植物是浮游动物的主要食物来源，在摄入有毒性的浮游植物之后，浮游动物的觅食能力下降，繁殖力下降，最终海洋的浮游动植物群落结构都会发生改变。同理，在海洋生态系统中的更高营养级动物，如海洋哺乳类和鸟类也会受到有机锡的间接和直接污染的毒害作用。
